Nie, formátovanie pevného disku nevymaže * všetok * jeho obsah. Zatiaľ čo formátovanie pripravuje disk pre nový súborový systém, prepísanie tabuľky prideľovania súborov a štruktúry adresárov, skutočné dátové súbory často zostávajú nedotknuté až do prepísania. Špecializovaný softvér na obnovenie údajov môže často načítať údaje z formátovaného pevného disku.
Formátovanie preto nie je bezpečnou metódou na trvalé odstránenie citlivých informácií. Na zabezpečené vymazanie sú potrebné robustnejšie metódy, ako je softvér Secure Erase alebo fyzické ničenie.