Facebook pixel sleduje iba návštevnosť webových stránok, s výnimkou aktivít používateľov v mobilnej aplikácii; pre takéto prípady sa používa Facebook SDK. Okrem toho nezachytáva údaje z režimu inkognito alebo súkromného prehliadania, pretože súbory cookie sú v takýchto nastaveniach zakázané. Ak majú používatelia vo svojich webových prehliadačoch aplikované blokátory reklám alebo súborov cookie, ktoré špecificky cielia na aktivity Facebook pixelov a zabraňujú im, sledovanie pixelov sa môže úplne zastaviť, čo vedie k nepresnostiam údajov.