Ako si vyrobiť fast súboru na Mac

formát fast súboru je formát založený na texte používaný reprezentovať nukleotidovej a peptidové sekvencie s jedno - písmenkovej kódy . Formát vznikol s softvérového balíka fast , ktorý bol vyvinutý na University of Virginia . Formát fast vyvinula do štandardu v oblasti bioinformatiky . Je možné si stiahnuť balíček fast softvér a vytvárať a porovnávať sekvencie na vašom vlastnom počítači Mac . Veci , ktoré budete potrebovať
fast spustiteľný program pre Mac OS X
terminálový program
Zobraziť viac Inštrukcie Cestuj 1

Stiahnite spustiteľný súbor z fast postavený pre Mac OS X ( pozri Zdroj 1 ) . Profesor WR Pearson z University of Virginia udržiava stránky so zdrojovým kódom a binárne spustiteľné súbory pre rad platforiem . Ako februára 2012 najnovšie binárne verzie fast pre Mac OS X je fasta - 35.4.11.macosxuniv.tar.gz .
2

Otvorte okno Finderi a navigovať pomocou ľavej bočný panel do svojho stiahnuť zložku . Dvakrát kliknite na spustiteľný binárny súbor Fast , ktorý ste stiahli . To bude dekomprimovať a vybrať z archívu balíček vytvoriť podpriečinok s názvom " fasta - 35.4.11 " v zložke k stiahnutiu .
3

Otvorte okno terminálu a prejdite do zložky Downloads z príkazového riadku . Príkaz v termináli bude " cd na stiahnutie" , ak používate predvolené nastavenia systému . Zo zložky Downloads , zadajte " cd fasta - 35.4.11 " vstúpite do zložky fast .
4

Zadajte príkaz " bin/fasta35-q seq/mgstm1.aa nasl /prot_test . lseg " v terminálovom okne . Tým sa spustí sekvencia dotazu testu na skúšobnom knižnice . Ak tento príkaz spustí správne , uvidíte súhrn časy skenovania a zvyškov sekvencie .
5

Vytvorte súbor Fast pomocou ľubovoľného textového editora , ako je napríklad aplikácia TextEdit alebo príkazom vi z terminálu . Súbor fast je jednoduchý textový súbor . Prvý riadok súboru musí obsahovať znak " > " , po ktorom nasleduje identifikátor sekvencie . Váš fast súbor by mal obsahovať sekvenciu DNA na zvyšných linkách .

• Predchádzajúca strana: Ako pridať krabice , ako je text v iWeb 
• Ďalšia strana: Čo je to Účel Mailertable súboru ?