Vitajte na [www.pocitac.win] Pripojiť k domovskej stránke Obľúbené stránky

Domáce Hardware Siete Programovanie Softvér Otázka Systémy

Na čo sa používa formát SDF?

SDF (Formát údajov o štruktúre) sa používa primárne na reprezentáciu chemických štruktúr molekúl . Je to široko používaný formát súborov v cheminformatike a výpočtovej chémii. Súbor SDF môže obsahovať jednu alebo viac molekúl, z ktorých každá má súvisiace štrukturálne informácie a prípadne ďalšie vlastnosti.

Informácie kódované v súbore SDF môžu obsahovať:

* Molekulárna konektivita: Atómy a väzby, ktoré tvoria molekulu.

* typy atómov: Typ prvku každého atómu (napr. C, H, O, N).

* súradnice atómu (3D): Priestorové umiestnenie každého atómu, čo umožňuje vizualizáciu 3D štruktúry molekuly.

* Molekulárne vlastnosti: Rôzne údaje spojené s molekulou, ako je molekulová hmotnosť, logp (koeficient oddielu oktanol-voda), úsmevy, struna, kľúč Inchi atď.

Súbory SDF sú zvyčajne textové a využívajú špecifický formát s riadkami začínajúcimi `> ` na označenie vlastností a dátových blokov obsahujúcich informácie o atóme a dlhopisoch. Ich flexibilita ich robí vhodnými na ukladanie veľkých zbierok molekulárnych štruktúr a ich pridružených údajov, čo z nich robí obľúbenú voľbu pre databázy a virtuálne skríningové aplikácie.

Najnovšie články

Copyright © počítačové znalosti Všetky práva vyhradené