Vo všeobecnosti sú Microsoft Office a OpenOffice navzájom kompatibilné a môžu otvárať súbory vytvorené v inom balíku. Pri používaní OpenOffice na otváranie súborov vytvorených v MS Office však môžu existovať určité obmedzenia alebo rozdiely vo formátovaní a naopak. Na zabezpečenie kompatibility je najlepšie uložiť súbory vo formáte, ktorý podporujú oba balíky, ako napríklad .docx pre dokumenty programu Word a .xlsx pre tabuľky programu Excel. Ak inštruktor konkrétne vyžaduje, aby študenti používali MS Office, odporúča sa použiť tento balík, aby sa predišlo možným problémom s kompatibilitou.