Ako extrahovať nezarovnané Číta Z BAM

BAM súbory sú binárne formáty sekvenceru čitateľov . Oni ukladanie vedeckých dát nukleotidov v komprimovanom formáte , miešanie obaja vyrovnané a nezarovnané číta dohromady . Sú ovládané pomocou " bam2fastq " nástroj , príkazom z počítača , ktorý je dodávaný s nainštalovaným mnohými nukleotid - sekvencovania programov ( môžete tiež získať zadarmo . ) Extrahovať nezarovnané číta zo súboru BAM , potom všetko , čo potrebujete , je Windows príkazového riadku . Návod dovolená 1

typ " bam2fastq " do ponuky Štart vyhľadávacieho riadku , aby sa uistil , že máte nástroj ( nemusíte otvoriť . ) Ak nie, si ho zadarmo založiť na zdroje .
2

typ " cmd.exe " do ponuky Štart vyhľadávacieho panelu . Kliknite na " cmd.exe " , keď sa objaví hore . Tým sa otvorí príkazový riadok systému Windows
3

Type " bam2fastq - nezarovnané FILELOCATION.bam " .. ( Bez úvodzoviek ) do príkazového okna
4

Vymeňte " FILELOCATION " s umiestnením súboru BAM . Použite format c: . \\ Složka1 \\ Složka2 \\ File.bam "
5

Hit " Enter " To sa pop - up textové okno s nezarovnané číta z daného BAM súboru < .. br >

• Predchádzajúca strana: Ako používať symfony bez Orm 
• Ďalšia strana: Ako zväčšiť veľkosť písmen a čísel na obrazovke môjho počítača