Vírusy Windows neovplyvňujú priamo používateľov Ubuntu, pretože vírusy sú špeciálne vytvorené tak, aby sa zameriavali na zraniteľnosti jedinečné pre operačné systémy Windows. Ubuntu ako linuxová distribúcia využíva inú systémovú architektúru a bezpečnostné mechanizmy nekompatibilné s týmito vírusmi špecifickými pre Windows. Výsledkom je, že používatelia Ubuntu vo všeobecnosti nie sú vystavení riziku infekcie zo štandardných malvérových programov založených na systéme Windows a môžu naďalej bezpečne používať svoje systémy na svoje vlastné účely.