Neexistuje jediný vynálezca počítačových vírusov. Koncept sebareplikujúceho programu sa datuje do raných dní výpočtovej techniky, pričom kľúčovú prácu vykonal v 50. rokoch John von Neumann a iní. Za prvý všeobecne známy počítačový vírus sa však všeobecne považuje vírus Creeper, ktorý v roku 1971 vytvoril Bob Thomas, výskumník z BBN Technologies. Vírus Creeper bol samoreprodukujúci sa program, ktorý sa šíril cez ARPANET, rannú počítačovú sieť. Zobrazí sa správa "Ja som liana, chyť ma, ak to dokážeš!" na infikovaných počítačoch.