Pri opätovnej inštalácii chladiča CPU je dôležité vyčistiť základňu chladiča a CPU, aby sa zabezpečila správna tepelná vodivosť a zabránilo sa prehriatiu. Na čistenie základne chladiča CPU by ste mali použiť handričku, ktorá nepúšťa vlákna, alebo vatový tampón navlhčený v izopropylalkohole (IPA). IPA je dobré rozpúšťadlo na odstraňovanie tepelnej pasty a iných nečistôt bez zanechania zvyškov. Nepoužívajte vodu ani iné tekutiny, pretože môžu poškodiť chladič alebo procesor. Jemne potierajte základňu chladiča navlhčenou handričkou alebo tampónom, kým sa neodstráni všetka teplovodivá pasta a iné nečistoty. Dávajte pozor, aby ste počas čistenia neohli alebo nepoškodili rebrá chladiča. Keď je základňa chladiča čistá, pred opätovnou inštaláciou ju nechajte na vzduchu úplne vyschnúť.