Proces, ktorý odstraňuje všetky údaje z disku a pripravuje ich na použitie, sa nazýva formátovanie na nízkej úrovni alebo niekedy
fyzické formátovanie . Toto sa líši od formátu na vysokej úrovni (napríklad formátovanie jednotky v systéme Windows alebo MacOS), ktorý vytvára iba systém súborov. Formátovanie nízkej úrovne v skutočnosti mení fyzickú štruktúru disku na veľmi základnej úrovni.