Samotné operačné systémy zvyčajne nezahŕňajú vstavané antivírusové funkcie, ktoré aktívne skenuje a odstraňuje vírusy rovnakým spôsobom, ako to robí špecializovaný antivírusový softvér. Zatiaľ čo moderné OS majú bezpečnostné funkcie, aby * chránili * pred niektorými hrozbami (ako napríklad pieskovisko, riadený prístup k súborom a zdrojom a kontrola používateľského účtu), ne lov po vírusoch aktívne ne lov. To je práca samostatných antivírusových programov.
Pomysli na to takto:OS je ako základ domu. Poskytuje štruktúru a základnú funkčnosť. Antivírusový program je ako bezpečnostný systém - ďalšia vrstva ochrany sa pridaná na vrchu, ktorá bude chrániť pred votrelcami (vírusy).